DeepMind、AIタンパク質に透かし

AIタンパク質設計ツールは、プラスチックを分解する酵素や毒タンパク質を阻害するものなど成功を生んできたが、同じツールは毒素の作製やウイルスタンパク質の改変にも使われうる。DNA配列をスクリーニングする既存ソフトはAI設計タンパク質を選别できない。脅威だと分かるほど十分に特徴づけられたものがなく、このリスクが指摘されてから1年近く経っても、誰も何ができるのか明らかではなかった。

DeepMindの研究は、Baker Labが開発した人気AI設計ツールProteinMPNNと、AI生成デジタル素材に微妙な透かしを加えるGoogleのSynthIDから出発した。チームのSynthIDBio変種は、ProteinMPNNがタンパク質を1アミノ酸ずつ組み立てる過程に介入し、タンパク質の構造と相互作用にまだ適合する場合にのみ、透かしと整合する選択肢を提案する。検出には鍵を使って配列全体を走査し、提案されたアミノ酸がどれだけ現れるかを測る必要があり、Googleはこれを実行するソフトも開発した。

Googleは、大学や大手バイオテク企業など信頼できる組織の鍵をDNA合成装置が保持し、未知のタンパク質が信頼できる供給元のAI設計かどうかを素早く見分け、信頼できないものの評価にリソースを集中できる姿を描く。実務で役立つかは鍵の配布、読み取れる信号を運ぶのに十分な長さのタンパク質、ProteinMPNN以外の設計ツールを同じ枠組みに取り込めるかにかかっており、元の形のままでは特に有用かどうかは明らかでない。